Prácticas de Bioinformáica: Linux, R, Blast


Intención de las prácticas

La idea es introducir a los alumnos al ambiente Linux, sobre todo la Terminal y el concepto de la línea de comando. Iremos viendo todos los comandos básicos tratando de usar ejemplos con relevancia biológica. Continuaremos con una introducción a R, un ambiente de programación estadística y algunos ejercicios con Blast.


  1. Introducción a Linux y la Terminal

  2. Linux y la Terminal 2



  3. BLAST en la línea de comando



  4. Introducción a R

  5. Introducción a R - parte 2




    6. Ejercicios Avanzados


  6. Manipulación de secuencias con R y Biostrings

  7. Descubrimiento de palabras reguladoras en secuencias no-codificantes

  8. Lo que falta, para “Descubrimiento de palabras reguladoras” (1)

  9. Lo que falta, para “Descubrimiento de palabras reguladoras” (2)



Cei Abreu (cei{at}langebio{dot}cinvestav{dot}mx)

Ligas útiles