LANGEBIO. Mexico.
Gustavo Hern‡ndez Guzm‡n1, Rodolfo L—pez Gomez2, Enrique Ibarra Laclette1, Victor A. Albert3, Luis Herrera Estrella1
1 Laboratorio Nacional de Gen—mica para la Biodiversidad, CINVESTAV Unidad Irapuato; 2 Laboratorio de Fisiolog’a Molecular de Plantas. Instituto de Investigaciones Qu’mico-Biol—gicas, Universidad Michoacana de San Nicolas de Hidalgo; 3 New York State Center of Excellence in Bioinformatics and Life Sciences, University at Buffalo (SUNY), USA.
RESUMEN (ABSTRACT)
Avances en la secuenciaci—n del genoma de Persea americana var. drymifolia
Gustavo Hern‡ndez Guzm‡n1, Rodolfo L—pez Gomez2, Enrique Ibarra Laclette1, Victor A. Albert3, Luis Herrera Estrella1
1 Laboratorio Nacional de Gen—mica para la Biodiversidad, CINVESTAV Unidad Irapuato; 2 Laboratorio de Fisiolog’a Molecular de Plantas. Instituto de Investigaciones Qu’mico-Biol—gicas, Universidad Michoacana de San Nicolas de Hidalgo; 3 New York State Center of Excellence in Bioinformatics and Life Sciences, University at Buffalo (SUNY), USA.
El aguacate (Persea americana) es un cultivo de alto valor para MŽxico, tanto cultural, econ—mico y nutricional. A nivel mundial, MŽxico es el principal productor y śnicamente Michoac‡n produce mas del 80% del aguacate que se distribuye al mercado nacional y extranjero. Si bien nuestro pa’s reune caracter’sticas ambientales que permiten una buena producci—n de aguacate, es necesario mejorar los programas agr’colas para aumentar su producci—n (25 Ton/Ha), que se encuentra por debajo de otros pa’ses como Israel, Chile y China, que recientemente entran al mercado.
Considerando que nuestro pa’s es centro de origen y tiene la mayor diversidad de especies de aguacate, se plantea el dise–o de una estrategia que permita mejorar tanto la producci—n y la calidad del fruto, mediante el estudio del genoma del aguacate criollo (Persea americana var. drymifolia), el cual posee un valor nutrimental mayor al de las variedades comerciales: alto contenido de minerales (Magnesio), vitaminas (vitamina E, glutati—n), ‡cidos grasos insaturados (olŽico, linolŽico, palm’tico y palmitolŽico), antioxidantes (lute’na) y metabolitos con capacidad antitumoral (Persina y beta-sitosterol).
En LANGEBIO tenemos secuenciadas 5 librer’as de cDNA de diferentes tejidos de aguacate (hoja, pulpa, ra’z, fruto completo y tallo), contamos con un mapa f’sico basado en BACs, con una cobertura de 5 veces el genoma y tenemos varias corridas con los secuenciadores de nueva generaci—n (Roche 454 y Solid). El objetivo es obtener una secuencia de aguacate de alta calidad, para analizar el genoma del aguacate criollo y sentar las bases para obtener variedades mejoradas, que permitan incrementar la producci—n de frutos con una mayor calidad organolŽptica y nutricional. En esta presentaci—n describiremos el avance en la secuenciaci—n y caracterizaci—n del tanto del transcriptoma como del genoma del aguacate.