Laboratorio Nacional de Gen—mica para la Biodiversidad del Centro de Investigaci—n y de Estudios Avanzados. MŽxico.
RESUMEN (ABSTRACT)
En la œltima dŽcada la tecnolog’a para la secuenciaci—n de ADN ha tenido avances sorprendentes que han reducido el tiempo y el costo de la secuenciaci—n de genomas completos de microorganismos, plantas y animales. La capacidad de secuenciaci—n de las nuevas generaciones de secuenciadotes se ha incrementado de decenas de miles de bases por d’a a miles de millones de bases por semana, con una reducci—n del costo de secuenciaci—n por base de mas de 100 veces. La disponibilidad de nuevos algoritmos para el ensamblado y anotaci—n de genomas ha facilitado, aœn para los no expertos, la caracterizaci—n funcional de los genomas de interŽs. Si hace 15 a–os secuenciar el genoma de una bacteria era un proyecto de muchos meses y un alto costo, ahora es cuesti—n de semanas y con un costo asequible para muchos laboratorios. La caracterizaci—n funcional de los genomas se ve beneficiada por la reducci—n en los costos para la secuenciaci—n masiva de cDNAs que permite ahora hacer an‡lisis globales de cambios en los programas de transcripci—n a un costo menor que los microarreglos, con una profundidad de cobertura muy superior. As’ mismo el avance en las tecnolog’as de espectrometr’a de masas han aumentado de manera significativa la caracterizaci—n de los perfiles metab—licos y prote—micos de un organismo determinado bajo diferentes condiciones ambientales. En la actualidad el gran reto es contar con personal capacitado para hacer los an‡lisis bioinform‡ticos necesarios para el ensamblado, anotaci—n y caracterizaci—n de los genomas secuenciados. En esta charla presentarŽ los avances en la tecnolog’a de secuenciaci—n de genomas y los retos para su an‡lisis, usando algunos ejemplos de genomas secuenciados en el Cinvestav Irapuato y en otros laboratorios del mundo.