REDBIO México 2010

Simposio: Tecnolog’as Emergentes: Las ÒOmicasÓ y su Impacto (Simposio plenario)
Responsable: Dr. Octavio Mart’nez de la Vega


La Metagen—mica y la Ecolog’a Microbiana del futuro

Francisco Rodriguez-Valera

Universidad Miguel Hernandez. Espa–a.

RESUMEN (ABSTRACT)
El abaratamiento y automatizaci—n de la secuenciaci—n de DNA durante los œltimos a–os han hecho de la gen—mica comparada y la metagen—mica las ciencias con mayor potencial en la Microbiolog’a. En la actualidad es posible abordar extensos programas de secuenciaci—n de metagenomas (DNA total de una comunidad) y de mœltiples aislados en cultivo puro con presupuestos muy razonables. Adem‡s, las nuevas tŽcnicas de secuenciaci—n tales como la pirosecuenciaci—n 454, no requieren la clonaci—n del material a secuenciar con lo que ahorra trabajo y se disminuyen posibles sesgos. El resultado es un cambio cualitativo en la informaci—n que los microbi—logos podemos obtener de los h‡bitats microbianos. Podemos acumular datos muy precisos de los tipos de microbios presentes en la muestra (censo) por an‡lisis de genes muy conservados como los que codifican para los rRNAs, las prote’nas ribosomales, gyrB o RpoB . Se pueden obtener censos de genes de importancia fisiol—gica como los centros de reacci—n de la fotos’ntesis, fijaci—n de carbono, obtenci—n de energ’a por diversos mecanismos ciclo del N etc. Finalmente se pueden buscar genes que codifiquen enzimas de interŽs biotecnol—gico, de s’ntesis de compuestos bioactivos entre otros muchos aspectos aplicados. Como contrapartida, las nuevas metodolog’as requieren un nuevo tipo de laboratorio donde el trabajo con ordenador (Òin silicoÓ) gana protagonismo frente al laboratorio hœmedo, incluso el perfil del microbi—logo de nueve generaci—n tiene que cambiarse con una formaci—n m‡s generalista en bioqu’mica y ecolog’a frente al prototipo superespecializado de estos œltimos a–os. De una forma o de otra, la Microbiolog’a est‡ cambiando a una velocidad vertiginosa y, es de esperar, que en los pr—ximos a–os veremos contestados muchos de sus grandes interrogantes.


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