REDBIO México 2010

Folio: 257
Tipo de presentación: Cartel
Tema: Gen—mica

Uso de Codones en Macrophomina phaseolina

Edgar Saul Rodr’guez L—pez 1*, Juan Manuel Gonz‡lez Prieto 2.
1 Centro de Investigaci—n en Ciencia Aplicada y Tecnolog’a Avanzada-Unidad Altamira. Km. 14.5 Carretera Tampico-Puerto Industrial Altamira. CP 89600 Altamira, Tams., MŽxico. 2 Centro de Biotecnolog’a Gen—mica. Boulevard del Maestro esq. El’as Pi–a s/n Col. Narciso Mendoza. CP 88710

RESUMEN (ABSTRACT)
"Las regiones codificantes de los ‡cidos nucleicos constan de tripletes de DNA denominados codones. Esta informaci—n es descifrada en la cŽlula para sintetizar las prote’nas mediante el c—digo genŽtico, en el cual, cada triplete codifica un amino‡cido, y un amino‡cido puede ser codificado por mas de un cod—n (uso sin—nimo de codones, SCU); esta caracter’stica hace que el c—digo genŽtico sea degenerado. El uso preferente de codones es espec’fico para cada organismo y puede implicar aspectos como la eficiencia en la traducci—n, la presi—n de selecci—n, las tendencias mutacionales, caracter’sticas estructurales y termodin‡micas del RNA o DNA. Macrophomina phaseolina (Tassi) Goid es un hongo fitopat—geno causante de la enfermedad denominada Ôpudrici—n carbonosaÕ que afecta a mas de 500 especies de plantas. En este trabajo se analizaron 2405 codones, pertenecientes a 17 marcos de lectura abiertos de M. phaseolina. El contenido total de bases en las secuencias fue de 28% citosina (C), 25% guanina (G), 24% timina (T) y 23% adenina (A). La proporci—n en el contenido de G+C en la primera posici—n del cod—n se representa como GC1, donde M. phaseolina posee un 54%, en la segunda posici—n del cod—n (GC2) un 47.7%, mientras que en la tercera posici—n (GC3) se encuentra un 61.3%. Estos resultados coinciden con los mostrados en otros hongos pat—genos como F. oxysporum, N. crassa, M. grisea y U. maydis donde el rango oscila entre un 52-56% del uso de GC del total de bases; GC1 en 55-58%, GC2 en 42-46% y GC3 en 57-65%. El uso mayoritario de G — C en la tercera posici—n del cod—n puede estar correlacionado con el nivel de expresi—n gŽnica, abundancia de los RNAt, y posiblemente un incremento en la eficiencia de la traducci—n. Un aspecto aplicado del uso de codones es el dise–o de sondas u oligonucle—tidos en el an‡lisis molecular para la identificaci—n de genes en este modelo de estudio."


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