REDBIO México 2010


Folio: 125
Tipo de presentación: Cartel
Tema: Biotecnolog’a Forestal

Inferencia Bayesiana aplicada a la detecci—n de regiones gen—micas asociadas a resistencia a pitch canker en Pinus radiata

Luis Orellana 1-2*, Sof’a Valenzuela 2-3, Priscila Moraga 2-3, Freddy Mora 3. 1 Facultad de Ciencias Biol—gicas,
Universidad de Concepci—n, Chile 2 Laboratorio de Gen—mica y Biolog’a Molecular, Centro de Biotecnolog’a, Universidad de Concepci—n, Chile 3 Facultad de Ciencias Forestales, Universidad de Concepci—n, Chile

RESUMEN (ABSTRACT)
"Las caracter’sticas como resistencia a estrŽs bi—tico y abi—tico son generalmente de tipo cuantitativo, es decir, su valor fenot’pico var’a en forma continua, determinada por la segregaci—n de mœltiples loci y cuya herencia es de tipo poligŽnica. A estas regiones se les conoce como loci de car‡cter cuantitativo o QTL. Para detectar los QTL involucrados en la resistencia a pitch canker, enfermedad causada por el hongo Fusarium circinatum en Pinus radiata, se emple— una familia F1, compuesta por 86 hermanos completos, los que fueron fenotipificados a travŽs de la longitud de lesi—n en tallo y genotipificados empleando 600 marcadores AFLP y 58 microsatŽlites. Con los datos genot’picos se construyeron los mapas de ligamiento genŽtico para cada parental, se excluyeron 208 marcadores por distorsi—n de segregaci—n, y posteriormente se realiz— la detecci—n de QTL mediante mapeo por intervalo bayesiano o BIM, implementado por medio del algoritmo de Gibbs. Este mŽtodo realiza la bœsqueda de QTLs entre marcadores considerando distribuciones a priori de los par‡metros y actualiz‡ndolos para dar como resultado la distribuci—n a posteriori de los mismos. Preliminarmente con 10.000.000 de iteraciones se identificaron tres QTL que explican en total un 10,3% de la variabilidad fenot’pica, y de los cuales dos estar’an relacionados con resistencia por sus efectos aditivos. Previa realizaci—n de mapeo por intervalo compuesto, se observ— que este mŽtodo disminuye la desviaci—n est‡ndar y aumenta la precisi—n respecto de las aproximaciones cl‡sicas al entregar la verdadera distribuci—n de los par‡metros y una detecci—n m‡s precisa de los QTL."


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